packages feed

bioinformatics-toolkit-0.2.3: tests/data/motif.meme

MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.303 C 0.183 G 0.209 T 0.306 

MOTIF lexA
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 14 E= 3.2e-035 
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000 
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000 
 0.857143  0.000000  0.071429  0.071429 
 0.000000  0.071429  0.000000  0.928571 
 0.857143  0.000000  0.071429  0.071429 
 0.142857  0.000000  0.000000  0.857143 
 0.571429  0.071429  0.214286  0.142857 
 0.285714  0.285714  0.000000  0.428571 
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000 
 0.285714  0.214286  0.000000  0.500000 
 0.428571  0.500000  0.000000  0.071429 
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000